2.4.2and3 GenBank:Eukaryotic Nucleic Acid Sequences mRNA and DNA

2.4.2&3 GenBank: 真核生物核酸序列mRNA&DNA

真核生物核酸序列mRNA

• Nucleotide中搜索 dUTPase 的 **成熟 mRNA(剪切掉内含子，只剩外显子)**序列信息 U90223

• 跟原核生物那个差不多，挑特别的两点来说

• 注意看清 CDS 的 note 部分，这里编码的是线粒体型的

  

• CDS和 mat_peptide末尾差了 3 个碱基，因为编码区最后 3 个碱基是终止密码子，不翻译氨基酸

  

真核生物核酸序列DNA

Nucleotide 中搜索 dUTPase 的 基因组 DNA 序列信息 AF018430。

LOCUS和ACCESSION可以不相同

• source / map

  

• gene / mRNA

  AF018429上的1到1735的碱基连上当前序列的1到1177号碱基，连上AF018431这条序列上的1到45号碱基，以此类推连起来就是一条完整基因

  

• 剪切后形成的 mRNA 有 2 种：

  上面的 mRNA 比下面的在前端多一个外显子，将被翻译成定位线粒体的信号肽，从而翻译出**线粒体型（mitochondrial form）**蛋白质

  下面没有信号肽的 mRNA 将被翻译成**细胞核型（nuclear form）**蛋白质

  

  • 这个表清晰的列出了四个片段中所有外显子的位置，能够清楚的看到线粒体型的比细胞核型的多了一个翻译成信号肽的外显子，其他的翻译成熟肽段的外显子都是一样的

    虽然信号肽最终也会被切掉，但是由此产生了两种亚细胞定位的蛋白质，有信号肽的会到线粒体中去，没有的将留在细胞核

    

• exon：当前这个序列所包含的外显子的位置及编号

  

  560到651号碱基是“DUT”基因的第3号外显子