2.4 Primer Extension Assay

希望无论是10碱基对还是1000碱基对的产物,他们的标记量都相同,这就要用到一个不同的分析实验

这跟掺入法不同,这叫引物延伸实验,与掺入法不同的是,被标记的是底物,我们在引物中掺入荧光基团或放射性标记的核苷酸,这个引物从5’端到3‘羟基端和先前的引物都一样,因此合成了一个标记过的引物-模板接头

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  • Make A Labeled PTJ (label on primer)

    Perform Run Same Way

    标记通常必须位于引物上,因为合成完成后,引物就成为产物的一部分,而模板一旦分离,就不再属于产物了,反应完全是一样的

  • Do Not Label dNTPs

    我们不标记dNTP,我们改变了标记方式,现在是在引物上,dNTP全是未被标记的

  • Can’t Analyze By Filter Binding

    那么你运行反应,你不能用滤纸结合分析来检测

    如果反应中完全没有DNA聚合酶,会有什么结果?

    滤纸上会有大量放射性标记的DNA,如果你完成了整个产物的合成反应,也会得到大量产物,因为起始产物和终产物被标记的数量基本相同

  • Can By Gel Separation

    能用凝胶分离法来检测,如果用溴化乙锭,结果看上去几乎和先前的结果是一样的,因为我们进行的就是相同的反应,但是如果用放射性同位素或者荧光法,会看到产物越来越长,但强度是一致的,因为无论是100碱基、1000碱基还是5000碱基,它们都连接着同样标记的引物,没有新的标记掺入