4.1 新一代测序——Next Generation Sequencing(NGS): Reads Mapping

From Sequencing to NGS

1977 测序方法

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新一代测序方法 能得到更深的测序深度

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  • Read：A short DNA fragment which is read out by sequencer

    由测序仪读出的一个短的DNA片段

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  • Quality：Given p = the probability of a base calling is wrong(碱基调用错误的概率), its Quality Score can be written as

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    质量分数小于20，错误率大于0.01的碱基，认为是不可靠的，如果这样的碱基超过reads的20%，就考虑将此条reads丢弃掉

  • Paired-End Reads 同时对序列两端较长的片段进行测序

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  • 新一代测序的出现，促进了很多的相关领域的研究

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  • RNA-Seq：Explore the transcriptome

    利用深度测序来研究转录组的技术——能让研究人员快速确定转录组

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